| 序号 | 工作任务 | 责任科室 |
| 1 | 文电、会务、机要、档案、宣传等日常事务运转工作；安全、保密、信访、对外交流、采购、固定资产和后勤服务管理等工作；受理权限范围内卫生健康领域违法行为的投诉、举报；负责财务和成本核算。 | 综合科 |
| 2 | 教学、科研、信息管理、专业技术人员培训。 | 科教科 |
| 3 | 建立、运行、维护本中心实验室质量管理体系；负责检验业务管理和实验设备管理； 指导下级疾控机构实验室质量管理工作；负责本单位卫生监督稽查。 | 质量技术管理科 |
| 4 | 急性法定传染病的预防控制、监测、预测和预警等工作；相关疫情和突发公共卫生事件的现场处理、流行病学调查及效果评价等工作；疾控监督员管理。 | 传染病预防控制科 |
| 5 | 重大传染病疫情、重大食品安全事件、群体性不明原因疾病等突发公共卫生事件应急监测、分析、评估、演练和处置的协调。 | 公共卫生应急管理科 |
| 6 | 全市免疫规划工作的组织、指导和实施，以及疫苗相关传染病的预防控制等工作；承担预防接种异常反应监测及调查诊断。 | 免疫规划管理科 |
| 7 | 艾滋病等监测与分析、预防控制、技术指导和相关管理。 | 艾滋病预防控制科 |
| 8 | 慢性非传染性疾病和伤害的监测、干预等预防控制。 | 慢性非传染性疾病预防控制科 |
| 9 | 食源性疾病、食品安全风险监测和卫生学评价工作;开展营养监测和食品安全事件现场调查处理工作;地方病防控工作。 | 营养与食品安全科 |
| 10 | 环境卫生相关疾病的预防控制、对策与技术指导工作;公共场所监测、卫生学评价，参与重大活动卫生保障;学生健康监测和学校(含幼儿园等)卫生相关卫生学调查、宣传教育、技术指导。 | 环境与学校卫生科 |
| 11 | 寄生虫病监测和预警工作;寄生虫病突发疫情的现场调查及处置技术指导等工作;消毒与病媒生物监测、预警及处置技术指导工作;重大病媒传染病、重大自然灾害等突发公共卫生事件中消毒及病媒生物处置技术指导。 | 寄生虫病防控与消媒监测科 |
| 12 | 病原微生物检测和鉴定、突发公共卫生事件的病原学检测 | 微生物检验科 |
| 13 | 食品安全、环境卫生、公共场所、健康相关产品、生活饮用水及涉水产品、碘缺乏病等地方病、突发公共卫生事件的理化检验。 | 理化检验科 |
| 14 | 权限范围内的公共场所卫生、生活饮用水卫生、涉水产品、学校卫生等监督执法工作，对公共卫生违法行为进行调查处理;负责公共卫生执法监督 | 公共卫生监督科 |
| 15 | 权限范围内的医疗卫生、传染病防治等监督执法工作，对医疗卫生、传染病防治违法行为进行调查处理;医疗卫生、传染病防治等执法监督。 | 医疗卫生监督科 |
| 16 | 权限范围内的职业卫生、放射卫生等监督执法工作，对职业卫生、放射卫生违法行为进行调查处理;职业卫生、放射卫生等执法监督。 | 职业卫生监督科 |
| 17 | 党务、人事、工资福利、工青妇和退休人员服务。 | 人事科 |